發(fā)現(xiàn)數(shù)百種潛伏在海洋中的神秘巨型病毒
科學(xué)家們剛剛發(fā)現(xiàn)了數(shù)百個(gè)新的巨人病毒,這是一項(xiàng)涵蓋全球海洋的綜合研究。
這項(xiàng)研究背后的團(tuán)隊(duì),來(lái)自邁阿密大學(xué)的海洋生物學(xué)家本杰明·明奇 (Benjamin Minch) 和病毒學(xué)家穆罕默德·莫尼魯扎曼 (Mohammad Moniruzzaman) 使用定制的計(jì)算機(jī)軟件來(lái)識(shí)別基因 組海水樣本中的微生物 – 包括 230 種以前不為科學(xué)所知的巨型病毒。
識(shí)別這些病毒是理解的關(guān)鍵部分海洋生物,特別是海洋生物的生存原生生物– 包括藻類、變形蟲(chóng)和鞭毛蟲(chóng)。
“通過(guò)更好地了解巨型病毒在海洋中的多樣性和作用,以及它們?nèi)绾闻c藻類和其他海洋微生物相互作用,我們可以預(yù)測(cè)并可能管理有害的藻華,這對(duì)佛羅里達(dá)州以及全世界的人類健康構(gòu)成危害,”說(shuō)莫尼魯扎曼。
得益于基因組數(shù)據(jù)庫(kù)、分析儀器和計(jì)算機(jī)程序(例如此處使用的計(jì)算機(jī)程序)中,發(fā)現(xiàn)巨型病毒的過(guò)程現(xiàn)在比以前容易得多——這讓科學(xué)家們對(duì)這些病毒的傳播和行為有了新的了解。
例如,巨型病毒通常是導(dǎo)致浮游植物,一種常見(jiàn)于海洋、湖泊和河流中的微小光合作用生物。這些生物對(duì)海洋生物和食物鏈至關(guān)重要,并產(chǎn)生大量的 Eartyh 氧氣,因此更多地了解捕食它們的病毒可能有助于保護(hù)工作。
除了 230 種新的巨型病毒外,該研究還確定了 569 種新的功能性蛋白,其中包括 9 種參與光合作用的蛋白。似乎在某些情況下,病毒能夠劫持光合作用功能為了獲得生存所需的能量。
“我們發(fā)現(xiàn)巨型病毒具有參與細(xì)胞功能的基因,例如碳代謝和光合作用——傳統(tǒng)上只存在于細(xì)胞生物中,”說(shuō)明奇。
“這表明巨型病毒在感染期間縱宿主的新陳代謝和影響海洋生物地球化學(xué)方面發(fā)揮著巨大的作用?!?/p>
研究人員能夠?qū)⑺麄儼l(fā)現(xiàn)的巨型病毒擬合到兩個(gè)現(xiàn)有的病毒訂單:Imitervirales 和 Algavirales。這些群體使用不同的感染策略,其中 Imitervirales 的遺傳最復(fù)雜,表示一種更靈活的 “l(fā)ife strategy”,可能允許病毒在更廣泛的宿主中生存。
我們知道,在全面了解生活在海洋中的生命時(shí),我們才真正觸及了表面:每一滴海水都是病毒泛濫,而海洋生物實(shí)際上也有幫助保護(hù)我們免受許多.
使用這項(xiàng)特定研究中概述的方法,也應(yīng)該會(huì)有更多的工作。仍然存在大量的病毒等待被發(fā)現(xiàn)并編目——并與海洋生態(tài)系統(tǒng)和健康放在一起。
“這項(xiàng)研究使我們能夠創(chuàng)建一個(gè)框架來(lái)改進(jìn)現(xiàn)有的新型病毒檢測(cè)工具,這可能有助于我們監(jiān)測(cè)水道中的污染和病原體?!?a>說(shuō)明奇。
該研究已發(fā)表在Nature npj 病毒.
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