《同濟大學學報(醫(yī)學版)》（雙月刊）創(chuàng)刊于1980年，本刊是以基礎醫(yī)學與臨床醫(yī)學研究為主的綜合性醫(yī)學學術期刊，國內(nèi)公開發(fā)行。中國科技論文統(tǒng)計源期刊，被重要數(shù)據(jù)庫和文獻期刊收錄。主要欄目有：實驗研究、調(diào)查研究、醫(yī)工結合、臨床研究、綜述、技術方法及短篇報道等。

《同濟大學學報(醫(yī)學版)》以馬克思列寧主義、毛澤東思想、鄧小平理論和“三個代表”重要理論為指導，貫徹科學發(fā)展觀，貫徹黨的教育方針和“百花齊放、百家爭鳴”的方針，主要反映本校的兩個文明建設，刊發(fā)學術文章，反映科研成果，指導教學實踐，交流科教學術信息，促進科教學術的繁榮發(fā)展。

《同濟大學學報(醫(yī)學版)》獲上海市優(yōu)秀科技期刊；全國高校優(yōu)秀自然科學學報及教育部優(yōu)秀科技期刊三等獎；2004年全國高校優(yōu)秀科技期刊評比中榮獲“優(yōu)秀編輯出版質(zhì)量獎”、首屆《中國學術期刊（光盤版）檢索與評價數(shù)據(jù)規(guī)范》執(zhí)行優(yōu)秀獎。